“termodinámica y cinética del
plegamiento”
Curso Fundamental
Temario
Presentación:
13 de febrero 2007, 9:00 h (todos los profesores).
SAlón
de usos múltiples Instituto de Química, Ciudad Universitaria.
I. Fundamentos de
termodinámica.
· Energía interna, capacidad calorífica, entalpía, entropía, energía libre de Gibbs, potencial químico. tres sesiones (16, 20 y 23 de febrero): JJG.
Clases en Facultad de Medicina.
II. Fuerzas principales involucradas en la estabilidad de proteínas
· Interacciones de van der Waals, interacciones electrostáticas, entropía conformacional, hidratación y efecto hidrofóbico. dos sesiones (27 de febrero y 02 de Marzo): EVC.
Clases en Instituto de Química.
Examen 06 de marzo (I
y II). En Instituto de Química.
III. Caracterización energética
del desplegamiento mediante técnicas espectroscópicas
·
Agentes desnaturalizantes:
urea, guanidina, pH, temperatura y presión.
· Cálculo de DG, DH, DS, DCp y Tm asumiendo el modelo de dos estados: bondades y limitaciones.
· Intermediarios estables de plegamiento.
· Complejos de proteína.
4 sesiones: (9,
13, 16 y 20 de marzo): GGR
Clases en Facultad de Medicina.
Examen 23 de marzo. En Facultad de Medicina.
IV. Calorimetría
· Bases teóricas y desarrollos experimentales de la calorimetría de alta resolución.
· Calorimetría de Barrido Diferencial.
· Análisis de termogramas
3 sesiones 27, 30 de marzo y 10 de abril: LT
Clases en Instituto de Química.
V. Orígenes moleculares de la energética de plegamiento: Estimación de las fuerzas de cohesión
· Entalpía, Entropía y Capacidad Calorífica.
· Mutaciones.
4 sesiones: 13,
17, 20 y 24 de abril: EG y JJG
La primeras clases en Instituto de Química y la última en Facultad de Medicina.
Examen: 27 de abril. (IV y V) En Instituto de Química.
VI. Fundamentos de cinética
· Mecanismos de reacción y leyes de velocidad, reacciones paralelas y en serie, la ecuación de Arrhenius, teoría del estado de transición, reacciones rápidas, reacciones controladas por difusión.
1 sesión: 4 de
mayo: GPH
Clase en Facultad de Medicina.
VII. La cooperatividad del plegamiento y sus implicaciones
cinéticas
·
La paradoja de Levinthal.
·
Transiciones de dos estados.
·
Isomerización de prolinas.
·
Intermediarios.
·
Estado de Transición.
· Modelos de plegamiento: Nucleación-Condensación
5 sesiones: 8,
11, 15, 18 y 22 de mayo: HNP
y JP
La primera clase en Instituto de Química, las demás en Facultad de Medicina.
VIII. Visión moderna sobre el plegamiento de proteínas: control termodinámico vs. control cinético
· Rutas y embudos de plegamiento.
· El estado de transición desde la perspectiva de los paisajes de energía.
1 sesión: 25 de
mayo: GPH
Clase en Facultad de Medicina.
Examen: 29 de mayo en Facultad de Medicina.
IX. Exposiciones por los alumnos de temas selectos del curso
2 Sesiones: 1 y 5 de Junio: todos los profesores.
La primera clase en Instituto de Química, las
segunda en Facultad de Medicina.
X. Entrega de
calificaciones 8 de junio en Facultad de Medicina.
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