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Áreas de interés:
Plegamiento de proteínas
Conferencia
Estado de transición del plegamiento de proteínas
Resumen
En una superficie que represente la energía de las diversas
conformaciones de una macromolécula, un estado de transición
comprendería el colectivo de conformaciones presentes en un
"paso" que conecta dos macro estados de la molécula ubicados
en "valles" (mínimos locales de energía). Los estados de
transición son barreras de energía (energía libre) que
determinan la velocidad de los cambios conformacionales
conducentes al equilibrio termodinámico. Una distribución de
Boltzmann de los estados indica que un estado de transición
está escasamente poblado, por lo que el estudio experimental
de sus características se hace a través de la medición de la
cinética de dichos cambios.
En particular, en los fenómenos de plegamiento (folding) y
desplegamiento (unfolding) de las proteínas, es común
determinar el efecto de la concentración de algún agente
desnaturalizante, tal como el cloruro de guanidinio, sobre
las velocidades de reacción en la
transición N (estado plegado) ⇔ U (forma desplegada).
A partir de experimentos de este tipo es posible inferir la
cantidad de área que se ve expuesta al disolvente cuando se
forma el estado de transición (ET), en relación al área
correspondiente en el estado N. De manera semejante, la
dependencia con la temperatura de la cinética de la reacción
de plegamiento proporciona información acerca del grado de
"compactación" estructural alcanzado en ET. Empleados en
conjunto, los estudios de tipo cinético y la caracterización
de propiedades termodinámicas en el equilibrio permiten
inferir la presencia, en caso de que ocurra, de
intermediarios estables en la ruta N ⇔ U, aunque tales
estados no sean detectables directamente en la cinética.
Es posible realizar un análisis más fino de la estructura
de los ET introduciendo mutaciones individuales en varias
zonas de la macromolécula y comparando el comportamiento
cinético de las mutantes con el de la proteína silvestre.